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干货分享 | NGS建库全攻略,助力建库实验成功率up up!

NGS(下一代测序技术):又称高通量测序,以高输出量和高解析度为主要特色。与传统的Sanger测序技术相比,下一代测序技术具有更高的通量、更快的速度和更低的成本。能够一次性对数百万到数十亿个DNA片段进行测序,大大缩短了测序时间,提高了测序效率。

△主要步骤△
通过物理或酶切打断基因组DNA,然后通过连接酶将接头连接到DNA片段上,最后通过PCR扩增。这种方法适用于全基因组检测。
利用Tn5转座子将DNA片段化、末端修复、接头连接等多步反应转变为一步反应,大大缩短了建库时间。适用于珍贵的样本或低核酸含量的样本。
针对目标区域设计特异探针,打断基因组DNA后与探针杂交,捕获目标区域。
利用PCR反应在待测DNA片段两端加上接头,适用于目标基因的捕获。
在进行NGS建库实验时,需要注意以下几个关键点,以确保实验的成功和数据的可靠性:
样本质量:确保样本的质量和纯度。RNA样本应无降解,DNA样本应无明显污染。
样本处理:在处理样本时,避免RNase或DNase污染,确保样本的稳定性和完整性。
片段大小:根据测序平台的要求,将DNA或RNA打断为适合的片段大小。通常,DNA片段化后应进行末端修复,确保片段末端适合接头连接。
打断方法:选择合适的打断方法,如超声波打断、酶切打断或转座酶打断。转座酶法建库利用Tn5转座子将DNA片段化、末端修复、接头连接等多步反应转变为一步反应,大大缩短了建库时间。
接头连接:确保接头连接的效率和准确性,避免非特异性连接。
文库扩增:通过PCR扩增文库时,注意控制PCR循环数,避免过度扩增引入偏差。
纯化步骤:在文库构建过程中,进行多次纯化步骤,去除杂质和未结合的接头。
质量控制:使用Qubit定量、Agilent 2100 Bioanalyzer或Qsep等工具进行文库质量检测,确保文库的浓度、片段大小分布、纯度符合测序要求。
杂交条件:在杂交捕获过程中,严格控制杂交温度和时间,以减少非特异性结合。
洗杂步骤:洗杂步骤需要多次洗涤,逐步去除未结合的DNA和杂质,确保目标DNA的纯度。
选择合适的试剂盒:根据实验需求和样本类型,选择合适的NGS建库试剂盒,可适用于多种样本类型,并且具有高连接效率和良好的兼容性。
预混液与自动化:选择即用型预混液的试剂盒可以减少操作步骤,提高效率,同时适配自动化解决方案。
NGS建库实验中可能会遇到各种问题,但通过仔细检查实验步骤、优化操作条件和选择合适的试剂盒,可以有效解决这些问题。希望上述解决方案能帮助您顺利进行建库实验。

1.DNA建库试剂盒
DNA Library Preparation Kit
货号:FG4103
● 支持多种样本类型:常规动植物基因组、微生物基因组、FFPE、cfDNA、ChIP DNA 等样本。
2.mRNA建库试剂盒
mRNA Library Preparation Kit
货号:FG4102
● 支持多种样本类型:包括动植物和真菌等真核生物的Total RNA。
3.FireQubit dsDNA高灵敏检测试剂盒
FireQubit dsDNA HS Assay Kit
货号:FG4101
● 灵敏度高;● 特异性强;● 耐受性好;● 线性范围宽;● 操作简便,兼容性。


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